DeepMind发布AlphaGenome 2,按细胞类型预测变异
事件综述根据 9 篇报道整理,11月11日更新
Google DeepMind 发布下一代 DNA 序列模型 AlphaGenome 2,可针对特定组织、细胞类型或细胞状态,预测 DNA 变异对基因表达、染色质可及性、组蛋白修饰和 DNA 甲基化的影响。DeepMind 称,该模型基于 68 种组织的 1 亿多条图谱训练,每次聚焦一种细胞类型,识别出的开关基因突变数量约为上一代模型的两倍;研究人员接入几十个细胞的数据即可适配新实验,无需重新训练。 DeepMind 称,该模型用于帮助科学家寻找疾病的细胞层面驱动因素;其研究员 Pushmeet Kohli 称,预测覆盖数百种人类细胞类型,并能在不重新训练的情况下适应未见过的细胞与疾病状态。The Verge 报道,DeepMind 表示更精细的预测计算成本更高,比上一代模型“更贵”。 AlphaGenome 2 及表达条件相关的交互式 Colab 教程即日起通过 AlphaGenome API 向非商业研究开放,商业研究需申请私密预览。DeepMind 表示,后续将在其智能体开发平台 Google Antigravity 中推出 AlphaGenome 2 Skills。DeepMind 注明,AlphaGenome 与 AlphaGenome 2 仅供研究使用,尚未经过临床或诊断用途的验证或批准。
综述由模型根据报道生成,细节以各篇原文为准。
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北京时间,最早在上Google DeepMind BlogDeepMind发布AlphaGenome 2细胞类型DNA预测模型
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9 篇,点开看摘要Google DeepMind 发布 AlphaGenome 2 基因组模型
Google DeepMind 发布 AlphaGenome 2,该基因组模型以细胞类型和状态为条件预测 DNA 变异对细胞的影响,可覆盖数百种人类细胞类型,并无需重新训练即可适配未见过的细胞与疾病状态。
入选理由基因组模型按细胞类型条件化预测变异效应,研究者可据此判断它在疾病相关变异定位上的可用范围。
阅读这篇报道谷歌 DeepMind 发布 AlphaGenome 2 基因序列模型,致病变异识别能力提升近一倍
谷歌 DeepMind 发布 DNA 序列模型 AlphaGenome 2,可预测 DNA 序列及其变异对特定人体细胞类型的影响,已通过 AlphaGenome API 面向非商业研究开放,商业研究处于私密预览阶段。
入选理由模型把变异效应预测从组织平均水平推进到单细胞类型,并已通过 API 向非商业研究开放,研究者可据此判断能否用于自身疾病变异分析。
阅读这篇报道Google DeepMind 发布 AlphaGenome 2 基因组模型,预测 DNA 变异对细胞的影响
Google DeepMind 发布下一代基因组模型 AlphaGenome 2,其预测以细胞类型和状态为条件,可覆盖数百种人类细胞类型,并能在不重新训练的情况下适应未见过的细胞与疾病状态。
入选理由基因组模型按细胞类型条件化预测变异效应,研究者可据此判断它在疾病相关变异定位上的可用范围。
阅读这篇报道Google DeepMind 发布 AlphaGenome 2,可预测同一 DNA 在不同细胞中的读取差异
Google DeepMind 发布 AlphaGenome 2,称其能预测同一段 DNA 在不同细胞之间被读取方式的差异,用于理解人类遗传学。该模型现已通过 API 和交互式 Colab 教程向非商业研究开放,详情见 https://goo.gle/4zikg3w。
阅读这篇报道Google DeepMind模型无需重训练适配实验
该模型还能即时适配实验室实验,无需重新训练。 研究人员只需接入几十个细胞的数据,就能观察DNA变化在特定时刻的表现,例如: 🔘 免疫细胞对疫苗的响应 🔘 肠道中驱动炎症性疾病的特定细胞 🔘 干细胞成熟为血细胞
阅读这篇报道Google DeepMind 发布 AlphaGenome 2,按细胞类型预测基因开关突变
Google DeepMind 发布 AlphaGenome 2,模型基于 68 种组织的 1 亿多条图谱训练,每次聚焦一种细胞类型,识别出的开启和关闭基因的突变数量约为上一代模型的两倍。团队用整块组织与模糊图像的类比说明,整体观察会漏掉单个像素层面的变化。
阅读这篇报道AlphaGenome 2 聚焦特定细胞解析疾病
你的心脏、大脑和免疫系统拥有相同的DNA序列。那么,单个字母的改变为何会影响某些细胞中的疾病,而不影响其余细胞? AlphaGenome 2 是我们的新AI模型,它能聚焦特定细胞,帮助科学家理解疾病的驱动因素。🧵
阅读这篇报道Google DeepMind 发布 AlphaGenome 2,按细胞类型预测 DNA 变异效应
Google DeepMind 发布 AlphaGenome 2,这是一个条件式 DNA 序列模型,可针对特定组织、细胞类型或细胞状态预测变异对基因表达、染色质可及性、组蛋白修饰和 DNA 甲基化的影响。
入选理由模型把变异效应预测从组织平均推进到单细胞类型,并开放非商业研究使用,遗传学研究者可据此判断能否用于自己的变异解读。
阅读这篇报道Google DeepMind 发布 AlphaGenome 2,预测遗传变异在具体细胞类型中的影响
Google DeepMind 发布基因组预测模型 AlphaGenome 2,可预测遗传变异对单个细胞类型和状态的影响,训练数据来自 68 种组织的逾 1 亿个细胞图谱。
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