全部动态

中国科学院团队开发整合空间转录组与连接组的深度学习框架 SpaCon

中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心等开发深度学习框架 SpaCon，整合局部空间信息、基因表达特征与全局脑连接模式，支持全脑尺度联合分析。研究结合小鼠脑空间转录组数据与 Allen 小鼠脑连接图谱，发现接受相似皮层输入的丘脑神经元基因表达特征相近，且该关联在谷氨酸能和 GABA 能神经元中较明显。成果在线发表于《科学通报》（Science Bulletin）。

Vadim Gladyshev 与衰老科学

哈佛医学院教授、美国国家科学院院士 Vadim Gladyshev 在访谈中讨论了衰老的本质及其与生物学衰老的区别，并梳理了基于蛋白质组、转录组、代谢组及可穿戴设备的多模态衰老时钟。他还谈及老年心脏移植与年轻心脏移植的预印本研究、小鼠异体共生实验，以及抗纤维化药物和 semaglutide 在 5 项随机试验中对生物学衰老的影响。

Cohere 公开 Qwen3.8 异常行为调查轨迹

Cohere 公开了针对 Qwen3.8 异常链接行为的调查轨迹、原始 token 和最小复现脚本，供开发者自行验证。该行为在不使用预填充的特定提示下出现但较罕见，若需复现可用带预填充的提示。Cohere 称开发者在自己机器上运行 Qwen3.8 时发现异常链接，开放权重让团队得以深入研究，并近期以 Apache 2.0 许可发布了多个开放权重模型。

Google推出AI Quests第三关Polar Peaks

AI Quests 第三关正式上线！🧠✨ 受我们十多年连接组学和神经科学研究启发，“Polar Peaks”邀请学生化身研究人员，绘制大脑中的神经通路。该关卡与 Stanford Accelerator for Learning 合作打造，向青少年展示人类判断如何塑造负责任的 AI。 了解更多：https://goo.gle/4ipdPVX

AI智能体能否更高效解决复杂问题

AI智能体能否更高效地解决复杂问题？此外，还有攻克编程瓶颈；从遥测数据中演进智能体技能；不同行业的AI需求差异；一款为教师节省时间的AI工具；天气预报领域的突破；BioEmu2进入公开预览。https://msft.it/6017aI27v

英国 AISI 测试开放权重蛋白质模型预训练数据过滤的有效性

英国 AI Security Institute 的 Chem-Bio 团队以开放权重的 ESM-2 蛋白质语言模型为对象，从 8M 到 3B 参数从头预训练，测试剔除病毒蛋白数据能否压制目标能力。

英国 AISI 发布 ReproBAIT 评测：AI 编码智能体能否从论文复现生物 AI 工具

英国 AI Security Institute 的 Chem-Bio 团队与 SecureBio 合作构建 ReproBAIT 评测，考察 AI 编码智能体在给定训练数据和有限公开信息时，能否设计、实现并训练出与现有生物 AI 工具功能相当的复刻版本。

Import AI 478：数学形式化辅助对齐研究、ProgramBench 与 Mirendil 的递归自我改进信号

Import AI 第 478 期汇总了多项 AI 科研进展：AI 安全初创公司 Resolution 用智能体自动形式化了与统计学习理论相关的数学命题，包括奇点消解，耗时约一周、约 100B 输入 token 与 3 亿输出 token，token 花费约 13.5 万美元，产出约 60 万行 Lean 代码。

英国启动1.65亿英镑国家AI生物安全计划，Google DeepMind 将参与合作

英国启动总额1.65亿英镑的国家AI生物安全计划（National AI Biosecurity Initiative），其中1亿英镑用于建设 AI Biosecurity Lab（AIBL），目标是利用英国科研力量与最新AI检测生物威胁、防范新出现的风险。Google DeepMind 的 Pushmeet Kohli 表示该机构将作为合作伙伴支持这一实验室，并称生命科学进入变革期，研究者、政府与产业需共同加强生物防御并负责任地引导这些新能力。相关数字与定位来自其引用的 @KanishkaNarayan 推文。

Hugging Face 发布 14.8B 开放 DNA 语言模型 Carbon-X，可直接用英文对话解读 DNA

Hugging Face 联合中关村学院与 TIGEM/那不勒斯费德里科二世大学发布 Carbon-X，这是一个 14.8B 参数、Apache 2.0 开放权重的 DNA 语言模型，可在对话中读取原始 DNA 并用英文作答，用于判断突变良性或致病、标记调控区、物种分类和碱基预测。

英国宣布设立AI生物安全实验室，政府投入1亿英镑并获OpenAI与Anthropic算力支持

英国政府24日宣布设立人工智能生物安全实验室，用于加强生物威胁监测与应对，并加快疫苗、药物等医疗应对手段的研发。该实验室将获得英国政府1亿英镑资金支持，以及OpenAI和Anthropic总计最高2亿英镑的算力等技术资源支持，并与谷歌深层思维公司及英国生物科技企业开展科研合作。

《科学》（20261022出版）一周论文导读：无线催化装置治糖胖病、多智能体AI框架加速药物发现

《科学》第394卷6822期导读涵盖多项研究：一种无线供电植入装置可将葡萄糖催化转化为葡萄糖酸盐经肾脏排泄，在小鼠实验中恢复正常血糖并去除部分多余热量负荷；"虚拟生物技术公司"多智能体AI框架由首席科学官智能体统一调度。

Pinal模型登《自然》：输入功能文字描述即可生成候选蛋白质序列

香港科技大学（广州）、西湖大学与中国科学院深圳先进技术研究院等团队合作提出蛋白质设计模型Pinal，相关研究发表于《自然》。模型以自然语言功能描述为输入，先生成蛋白质三维结构再设计氨基酸序列，训练数据含17亿组蛋白质—文本配对、覆盖约1.35亿条序列，参数规模160亿。

入选理由研究者可据此了解文字到功能蛋白的闭环如何做实验验证，以及模型在定量性质指定上的边界。

基于蛋白质语言模型的 KaML-ESM 预测蛋白质电离态与 pKa

美国马里兰大学药学院团队在 Nature Communications 发表 KaML-ESM，用 ESM 蛋白质语言模型构建序列神经网络，在 GAINES 增强的 PKAD-3r 数据集上训练，预测 Asp/Glu/His/Cys/Tyr/Lys 残基电离常数。

英国投入约 6 亿英镑应对 AI 风险，将建 AI 生物安全实验室

英国政府宣布投入约 6 亿英镑应对 AI 带来的公共卫生和安全风险，其中最多资金投向生物安全计划，包括斥资 1 亿英镑建立 AI 生物安全实验室以识别生物威胁，另投入 6,500 万英镑研发针对病原体的防范和应对措施。

Scientific Agent Skills 获 54k 星

我们的开源仓库 Scientific Agent Skills 在 GitHub 上刚刚达到 54k 星！

Kimi K3.1 Pro 发布：3T 级开源权重模型，支持 100 万 token 上下文

Moonshot AI 推出 Kimi K3.1 Pro，这是其 K3.1 系列首款模型，也是迄今最强的 3T 级开源权重模型，具备 100 万 token 上下文窗口。

OpenAI 联合 PerturbAI 与斯克里普斯研究所用数千个 AI 智能体分析小鼠脑细胞图谱

OpenAI 联合 PerturbAI 和斯克里普斯研究所利用数千个 AI 智能体分析覆盖整个小鼠大脑的 CRISPR 图谱，32 分钟完成数百万个脑细胞数据的分析，团队估计人类研究人员完成同等工作需数月到一年。

Nature Machine Intelligence 发布蛋白–配体结合预测评估指南

Ballester 与 Tran-Nguyen 在 Nature Machine Intelligence 提出评估蛋白–配体结合预测方法的规范，主张在数据、代码和实验流程上保持透明。文章讨论防止数据泄漏与偏差的良好实践，以实现不同打分方法之间公平、可复现且有意义的比较。

Anthropic 公开征集生命科学客座研究员，合作 8–12 周并开源数据代码

Anthropic 面向学术机构、非营利组织和政府实验室的 PI 及其研究组公开征集客座研究员提案，用 Claude 研究因果人类生物学、结构与计算分子生物学、药物化学、药物发现和临床科学等问题。

入选理由Anthropic 公开征集生命科学客座研究员，由公司承担模型与工具成本并开放数据代码，研究者可据此判断申请路径与产出归属。

Principia：在测试时从假设迭代构建科学原则的 LLM 框架

研究者提出基于大语言模型的框架 Principia，在测试时从相关输入与观测结果中形成对比性因果假设，再把反复出现的关系归纳为原则，并用新观测修正假设、重建原则。在分子优化、蛋白质工程、基因扰动和分子性质预测等基准上，该框架优于依赖内部知识、外部来源或经验总结的基线，生成的原则与科学文献相符；代码已在 GitHub 公开。

Hugging Face 联合 TIGEM 等机构发布开放 DNA 模型 Carbon-X

Hugging Face 与 TIGEM、那不勒斯费德里科二世大学和中关村学院合作训练了 Carbon-X，这是一个 14B 开放模型，可直接读取原始 DNA 并用自然语言描述。

入选理由开放权重、可在笔记本上运行的 DNA 模型，让学术实验室能自行评估它能否用于变异解读这类日常任务。

Warp Sciences 成立，用AI与机器人加速新药研发

💥 隆重介绍 Warp Sciences，一家运用 AI 和机器人技术帮助世界更快开发新药的新公司。 我们已完成由 @lightspeedvp 领投的 2.15 亿美元 A 轮融资，旨在将前沿 AI 从浏览器带入实验室，并在美国本土构建科研能力。 我与多年好友 @dpatil、FAIR 联合创始人 @manohar_paluri 以及药物研发专家 Sol Reisberg 共同创立了 Warp。早期团队汇聚了众多杰出人才，例如曾助力 LLNL 实现 Q>1 聚变的 @bkspears9。

OpenAI 收购 Orchestra Bio，将药物研发协调智能体并入 Rosalind 平台

OpenAI 收购了帮助药企团队协调药物研发的初创公司 Orchestra Bio，并将其并入面向生命科学的 AI 平台 Rosalind。Orchestra 的智能体用于跟踪试验、在出现失败批次等问题时标记受影响的时间线并给出后续选项，目标是打通科学发现与临床试验、决策之间的环节。交易金额未披露，OpenAI 此前已与 Novo Nordisk 和 Moderna 在 AI 药物研究上合作。

Hugging Face 开源 DNA 模型 Carbon-X，基于 Qwen3-14B 训练

Hugging Face 发布开源 DNA 模型 Carbon-X，以 Qwen3-14B 为基础，在 300B tokens 的 DNA、英文与交错数据上做中训练，并采用英文 BPE 加 DNA 6-mer 的混合分词器。

Citrini Research 与 Anthropic 用 Claude 尝试研发蝎子抗毒血清未果

投资研究公司 Citrini Research 与 Anthropic 合作，用一款未发布的 Claude 模型设计能结合蝎子毒素的蛋白质，最终未造出药物。Anthropic 称 Claude 在 64 小时内生成近 32 万个候选，筛出 180 个设计，另加 31 个共 211 个；外部实验室测试中 17 个蛋白能结合目标，但每个最多只结合一种毒素，且未验证能否中和毒素。

OpenAI 智能体 32 分钟完成小鼠全脑 CRISPR 图谱分析

OpenAI 与 PerturbAI、Scripps Research 合作，用数千个基于 GPT-Rosalind 的 AI 智能体分析数百万个小鼠细胞的全脑 CRISPR 图谱，每个智能体负责一个基因扰动并检索文献解释细胞反应，整个分析耗时 32 分钟，团队估算人工完成需数月至一年。

预印本调查：221 篇论文中 230 例本不该出现的蛋白条带

一项由单人完成的预印本调查针对 20 种存在明确基因缺失或突变的细胞系检索 Western blot 实验，在 221 篇论文中找到 230 例本不应出现的蛋白条带。

Claude 在 Claude Science 中自主设计蛋白结合体，靶向蝎毒神经毒素

Anthropic 的 Claude 在面向研究者的 Claude Science 环境中，针对 4 种蝎子的 5 种毒素自主生成 318,484 个蛋白结合体设计，首次提示后自行工作 24 小时，随后由研究团队追加指令引导。

入选理由材料给出从设计到湿实验验证的完整链条与命中率，研究者可据此判断自主智能体在蛋白设计中的实际位置。

Frontiers in Science：靶向 GPCR 网络或可延缓衰老

研究人员在 Frontiers in Science 发表论文提出，靶向 G 蛋白偶联受体（GPCR）信号网络的疗法有望同时干预多种衰老相关疾病。作者认为，AI、系统生物学与精准医学的进展可支持基于个体衰老生物标志物的个性化治疗，并与代谢疗法、再生医学等长寿策略互补。该方案目前仍属研究构想，尚待验证。