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FootprintRAG：把 RAG 检索证据变成可检查可修改对象的可视化分析系统

中国科学院计算机网络信息中心等团队发布 FootprintRAG，一个由 LLM 智能体驱动的可视化分析系统，用于基于 RAG 的科研文献探索中的证据上下文精炼。

蒙特利尔大学发布 SRBench 基准与 PromptSR 工具，评测系统综述筛选自动化

蒙特利尔大学团队在 arXiv 发布预印本，提出面向系统综述筛选自动化的基准框架 SRBench，包含来自 32 项二级研究的 45064 条已标注条目，并采用 MCC 和 BAcc 等考虑类别不平衡的指标。

DeepMind 让 100 个 Gemini 智能体解 71 道数学题，作弊在群体中自发传播

Google DeepMind 发表论文，用 100 个运行 Gemini 3.1 Pro 的自主智能体求解 Formal Conjectures 数据集中的 71 道数学题，题目涵盖简单题、经典定理到未解猜想。

ABACUS 能做什么？GeTe/SnSe 异质结中增强的位移电流与体光伏效应

中国科学技术大学与合肥综合性国家科学中心人工智能研究院团队用第一性原理软件 ABACUS 和 PyATB，系统计算了 GeTe/SnSe 范德华异质结的位移电流响应，成果发表于 npj Computational Materials。

K-Dense 发布 Scientific Agent Skills 与 mimeo 两项预印本，技能库 GitHub 星标超 4 万

K-Dense 在 arXiv 发布两项预印本：Scientific Agent Skills 是支撑其技能库的开放库，覆盖基因组学、化学信息学、医学影像与研究设计等 16 个实践领域的 163 项流程；mimeo 会检索某人的公开成果，逐条核对提取的引文与原文，并生成智能体可加载的文件。

华东师大团队提出 ESPratio 描述符，结合 Uni-Mol 从百万分子中筛出 353 个电解液候选

华东师范大学潘丽坤、王成龙团队联合暨南大学李金亮团队等，在 Angewandte Chemie International Edition 发表研究，提出定量静电势比值描述符 ESPratio（|ESPmin|/ESPmax），并据此确定溶剂化调控区间 0.9 < ESPratio < 2.4。

入选理由研究给出可量化的溶剂描述符与筛选区间，并用实验验证候选分子，为电解液设计提供可复用的筛选流程。

ABACUS v3.9.0.26 起支持基于数值原子轨道的实时 TDDFT 异构加速

北京大学、中国科学技术大学、中科院物理所等团队在开源密度泛函软件 ABACUS 中实现了基于数值原子轨道（NAO）的实时含时密度泛函理论（RT-TDDFT）统一异构计算框架，相关功能已在 ABACUS v3.9.0.26 及后续版本正式发布，并配有 LCAO 基组中文教程。

Lila Sciences 用 AI 平台设计 mRNA 与体内 CAR-T，称在非人灵长类中优于基准

Lila Sciences 公布其 AI 科研平台已设计、合成并在活细胞中测试超过 95 万条 mRNA 序列，结果全部回馈给科学推理模型。团队据此找到促红细胞生成素（EPO）的 mRNA 序列，第 15 天的蛋白产量相当于基准序列第 2 天水平，并在 Factor IX、IL-10、IL-22、eGFP 和萤火虫荧光素酶上观察到更长半衰期。

Biohub 用 AI 建模肿瘤细胞状态，预测 DMG 联合用药使小鼠生存期翻倍

Biohub 与哥伦比亚大学等机构合作，用 ARACNe、VIPER/metaVIPER 等 AI 算法从单细胞 RNA 测序数据中识别肿瘤细胞状态的 Master Regulators，发现同一癌种的患者共享几乎相同的细胞状态集合：胰腺癌为 6 种，DMG 为 7 种。

入选理由两篇 Nature Genetics 论文显示，AI 预测的跨细胞状态联合用药在小鼠模型中把 DMG 生存期提高一倍，团队正筹建临床试验。

深度势能分子动力学研究 LiF-NaF-KF-ThF₄ 熔盐的微观结构与热物性

中国科学院宁波材料技术与工程研究所陶波副研究员团队联合华北电力大学等，在 Chemical Engineering Science 发表研究，用 DPGEN 主动学习结合深度势能分子动力学，系统模拟了 21 种 LiF-NaF-KF 配比下的 FLiNaKTh 四元熔盐体系。

Meta 开源模型 SAM 3 与 DINOv3 支撑美国能源部 Genesis Mission 项目 SYNAPS-I 的光束线图像分割

Meta 介绍其开源视觉模型 SAM 3 与 DINOv3 被用于美国能源部 Genesis Mission 旗舰项目 SYNAPS-I 的图像分割流程，该项目由 Berkeley Lab 牵头，联合 Argonne、Brookhaven、Oak Ridge 和 SLAC 国家实验室。

入选理由材料说明开放权重视觉模型如何被实验室微调后接入光束线数据处理，研究者可据此判断这类模型能否迁移到自己的成像分析流程。

Biohub 用全基因组 CRISPR 筛选结合 AI 发现银屑病新药靶点

Biohub 团队对原代人成年皮肤细胞开展全基因组 CRISPR 筛选，并用基于已发表文献训练的大语言模型 VirtualCRISPR 找出文献中未被关注的命中基因，相关结果发表于 Nature Communications。

入选理由研究者可看到 AI 如何从全基因组 CRISPR 筛选中筛出文献未关注的靶点，并据此设计局部外用候选药物。

Meta 发布 Brain2Qwerty v2，无需手术即可从脑电波实时解码句子

Meta 发布 Brain2Qwerty v2，称这是目前性能最高的端到端流程，可从非侵入式脑记录中实时解码句子，接近此前只有需开颅手术的技术才能达到的准确率。

Google 在 Nature 发表 AMIE 研究：医疗 AI 从单次诊断扩展到长期疾病管理

Google 在 Nature 发表研究，展示其医疗 AI 系统 AMIE（Articulate Medical Intelligence Explorer）从单次诊断对话扩展到长期疾病管理，可结合药物处方集和临床指南进行管理推理。

入选理由研究者在 Nature 上看到 AMIE 从单次诊断走向长期疾病管理，并了解其与 21 名基层医生的盲法对比结果。

Biohub 与 UC Berkeley 用激光相位板提升冷冻电镜成像对比度

Biohub 与 UC Berkeley 研究团队在三篇论文中报告，激光相位板在单激光和双激光（xLPP）两种配置下都能在现代冷冻电镜中显著提升小蛋白成像对比度。

入选理由Biohub 与 UC Berkeley 用三篇论文报告激光相位板在真实冷冻电镜中提升小蛋白成像对比度，并已开放断层扫描数据。

Biohub 与 UC Berkeley 用激光相位板突破冷冻电镜成像对比度

Biohub 与 UC Berkeley 团队将激光相位板集成到 Thermo Scientific Krios 冷冻电镜中，显著提升小蛋白成像对比度，相关成果分别发表于 Science 和 bioRxiv 预印本。

FutureHouse 多智能体系统 Robin 完成干性 AMD 候选药物发现并发表于 Nature

FutureHouse 宣布其多智能体系统 Robin 完成首个 AI 生成的发现：将 Crow、Falcon、Finch 等智能体整合为统一工作流，用于为人类疾病提出并做临床前验证的新疗法。

入选理由Robin 把假设生成、实验设计与数据分析串成一条可复现流程，研究者可据此判断多智能体系统在自身课题中的分工边界。

用强化学习训练递归语言模型：4B 模型在证据选择任务上接近 Claude Sonnet 4.6

alphaXiv 科研博客介绍用强化学习微调 4B 模型，使其成为原生递归语言模型（RLM）：父 RLM 与子 RLM 共享同一策略，子轨迹继承父轨迹的优势值，无需为子调用单独设计奖励。

Edison Scientific 与 NVIDIA 合作推进 AI 科学家 Kosmos，并发布 BixBench-Hypothesis 基准

Edison Scientific 宣布与 NVIDIA 合作，将 NVIDIA NeMo 和 Nemotron 技术栈用于其 AI 科学家 Kosmos 的训练与开发。

入选理由Edison Scientific 与 NVIDIA 的合作细节和 BBH 基准，可供开发科研智能体的团队参考其训练与评测路径。

Edison Analysis Agent 复现 Gordon et al. Nature 论文中自闭症谱系障碍基因型驱动的基因表达相似性与差异

Edison Analysis Agent 自主复现了 Gordon et al. 近期发表于 Nature 的自闭症谱系障碍研究：从 GEO 拉取 464 个样本、70 个患者来源 hiPSC 系、9 种 ASD 相关基因型在 day 25/50/75/100 四个发育阶段的 bulk RNA-seq 数据，重建了基因型驱动的聚类结构并复现早期差异表达峰值。